دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی تهران بازماندهٔ مدرسهٔ طب موسسه دارالفنون تهران است، و به این لحاظ از کهن ترین موسسات علوم پزشکی آکادمیک ایران محسوب میگردد. مدرسه طب تا سال ۱۳۰۳ شمسی در دارالفنون دایر بود. در سال ۱۳۰۲ رئیس الوزرا عمارت مسعودیه را به مبلغ ۳۹ هزار تومان خریداری و برای تاسیس مدرسه علوم عالیه به وزارت معارف هدیه نمود. در سال ۱۳۰۳ پس از تعمیرات الزم وزارت معارف بدان محل منتقل و شعب مدرسه طب و دوا سازی در کی از حیاطهای آن تشکیل شد. چندی بعد مدرسه طب به عمارتی واقع در خیابان لاله زار نو و سپس به عمارت بیمارستان معتمد ودر اسفند ماه ۱۳۱۶ به محل فعلی دانشکده پزشکی دانشگاه علوم پزشکی تهران منتقل و در زیر مجموعه دانشگاه تهران فعالیت خود را از سرگرفت.
بسیاری از موسسات و دروس این دانشگاه توسط شارل ابرلن پایه گذاری گردید.
در سال ۱۹۸۶ دانشکدههای علوم پزشکی از دانشگاه تهران رسما بدستور بخشنامه جدید دولت جدای و مستقل گردیدند و دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی تهران را تشکیل دادند. اما بر اساس تفاهم نامه بین دو دانشگاه، اعضای هیات علمی دانشجویان وپژوهشگران دو دانشگاه کماکان متعهد هستند مقالات علمی و پژوهشی خود را در مجلات وکتب وکنفرانسهای خارجی وبین المللی با یک نام به چاپ برسانند.